Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nus1Q99LJ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nus1Q99LJ8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms