Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q99KU6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99KU6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99KU6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99KU6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99KU6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99KU6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q99KU6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q99KU6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q99KU6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q99KU6 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms