Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ubxn2aQ99KJ0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms