Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
NSUN4Q96CB9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NSUN4Q96CB9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms