Protein–RNA interactions for Protein: Q922B6

Traf7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf7Q922B6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Traf7Q922B6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Traf7Q922B6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms