Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Slc5a4bQ91ZP4 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms