Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Atg13Q91YI1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Atg13Q91YI1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms