Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pth2Q91W27 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Pth2Q91W27 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239.1 ms