Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cacng8Q8VHW2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cacng8Q8VHW2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms