Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppargc1bQ8VHJ7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms