Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SelenomQ8VHC3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SelenomQ8VHC3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms