Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD7

Kdm4c, Lysine-specific demethylase 4C, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4cQ8VCD7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kdm4cQ8VCD7 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Kdm4cQ8VCD7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Kdm4cQ8VCD7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms