Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3W2

0610009B22Rik, MCG6979, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
0610009B22RikQ8R3W2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
0610009B22RikQ8R3W2 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
0610009B22RikQ8R3W2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms