Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND04

SMG8, Protein SMG8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 991 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG8Q8ND04 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SMG8Q8ND04 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMG8Q8ND04 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMG8Q8ND04 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms