Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc12Q8K5B8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Hoxc12Q8K5B8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms