Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Colec12Q8K4Q8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Colec12Q8K4Q8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms