Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Hecw1Q8K4P8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hecw1Q8K4P8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms