Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
OptnQ8K3K8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
OptnQ8K3K8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
OptnQ8K3K8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms