Protein–RNA interactions for Protein: Q8K199

Cmc2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmc2Q8K199 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc2Q8K199 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc2Q8K199 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc2Q8K199 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc2Q8K199 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cmc2Q8K199 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cmc2Q8K199 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cmc2Q8K199 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms