Protein–RNA interactions for Protein: Q8CF02

Fam25c, Protein FAM25C, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam25cQ8CF02 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fam25cQ8CF02 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fam25cQ8CF02 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.5 ms