Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Slx1bQ8BX32 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Slx1bQ8BX32 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms