Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNV1

Trmt2a, tRNA (uracil-5-)-methyltransferase homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt2aQ8BNV1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt2aQ8BNV1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt2aQ8BNV1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt2aQ8BNV1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt2aQ8BNV1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt2aQ8BNV1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt2aQ8BNV1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trmt2aQ8BNV1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Trmt2aQ8BNV1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Trmt2aQ8BNV1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms