Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Gga3Q8BMI3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gga3Q8BMI3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gga3Q8BMI3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms