Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnrc6bQ8BKI2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tnrc6bQ8BKI2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Tnrc6bQ8BKI2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms