Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ83

Tm2d3, TM2 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d3Q8BJ83 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tm2d3Q8BJ83 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tm2d3Q8BJ83 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms