Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIE6

Frmd4a, FERM domain-containing protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 1,020 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmd4aQ8BIE6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Frmd4aQ8BIE6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Frmd4aQ8BIE6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms