Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHJ7

Gabra5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra5Q8BHJ7 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gabra5Q8BHJ7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gabra5Q8BHJ7 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gabra5Q8BHJ7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms