Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tnpo1Q8BFY9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnpo1Q8BFY9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnpo1Q8BFY9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms