Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZA4

Pkhd1l1, Fibrocystin-L, mousemouse

Predictions only

Length 4,249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkhd1l1Q80ZA4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Pkhd1l1Q80ZA4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Pkhd1l1Q80ZA4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Pkhd1l1Q80ZA4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms