Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Otop3Q80UF9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Otop3Q80UF9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Otop3Q80UF9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms