Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Avl9Q80U56 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Avl9Q80U56 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms