Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atf7ipQ7TT18 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atf7ipQ7TT18 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atf7ipQ7TT18 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms