Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ube2q1Q7TSS2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ube2q1Q7TSS2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ube2q1Q7TSS2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms