Protein–RNA interactions for Protein: Q791N7

Znrd1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrd1Q791N7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Znrd1Q791N7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrd1Q791N7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms