Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rph3alQ768S4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rph3alQ768S4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms