Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sned1Q70E20 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sned1Q70E20 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms