Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpv1Q704Y3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpv1Q704Y3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms