Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Topbp1Q6ZQF0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Topbp1Q6ZQF0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Topbp1Q6ZQF0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Topbp1Q6ZQF0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms