Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPL9

Ddx55, ATP-dependent RNA helicase DDX55, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx55Q6ZPL9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ddx55Q6ZPL9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx55Q6ZPL9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx55Q6ZPL9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms