Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf653Q6YND2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Znf653Q6YND2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf653Q6YND2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Znf653Q6YND2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Znf653Q6YND2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Znf653Q6YND2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms