Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Dtx4Q6PDK8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Dtx4Q6PDK8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms