Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
BC061212Q6P8K3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
BC061212Q6P8K3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms