Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8I4

Pcnp, PEST proteolytic signal-containing nuclear protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnpQ6P8I4 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PcnpQ6P8I4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PcnpQ6P8I4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms