Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U7

Nwd2, NACHT and WD repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nwd2Q6P5U7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nwd2Q6P5U7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nwd2Q6P5U7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nwd2Q6P5U7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms