Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5C5

Smug1, Single-strand selective monofunctional uracil DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smug1Q6P5C5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Smug1Q6P5C5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smug1Q6P5C5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms