Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFCAB12Q6NXP0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EFCAB12Q6NXP0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EFCAB12Q6NXP0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms