Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Szrd1Q6NXN1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Szrd1Q6NXN1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Szrd1Q6NXN1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms