Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSQ7

Ltv1, Protein LTV1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltv1Q6NSQ7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ltv1Q6NSQ7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ltv1Q6NSQ7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms