Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc66Q6NS45 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc66Q6NS45 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc66Q6NS45 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms