Protein–RNA interactions for Protein: Q6JPI3

Med13l, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13-like, mousemouse

Predictions only

Length 2,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13lQ6JPI3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Med13lQ6JPI3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Med13lQ6JPI3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms